《科学家》杂志(The Scientist Magazine)近日评选出2015年十大创新产品,评出了对科研和医学领域影响较大的测序仪、试剂盒、基因组编辑产品和其他技术,赛默飞、珀金埃尔默、Illumina、安捷伦(Seahorse Bioscience)等生命科学仪器公司纷纷登上榜单。
如今越来越多的实验室配备DNA测序系统,比如Illumina台式测序仪。但这些测序仪只能生成几百bp的读取,容易丢失一些长距离基因组信息(比如结构变异、多态性和单体型)。今年夏天测序黑马公司10X Genomics正式推出GemCode测序平台却可以解决这一问题。该系统目前售价为75,000美元,可兼容Illumina测序仪。
今年年初,Illumina发布的MiSeq FGx法医基因组学测序系统,将二代测序技术带入了法医实验室。过去法医实验室比较依赖于低分辨率的毛细管电泳测序法,但现在他们可以享受到高分辨率的基因分型。MiSeq FGx能够很好的检测高度降解的DNA样本或混合性样本,解决传统方法难以处理的问题。
赛默飞9月份最新发布两款新一代测序产品Ion S5和Ion S5 XL,从DNA到测序数据,整个过程的手动时间不到45min,可以为人们提供了更流畅的测序流程。这是赛默飞收购Life Tech以来首次扩展测序产品线,新的Ion S5和Ion S5 XL将组成Ion Torrent中端产品线,其价格和通量介于Ion PGM和Ion Proton之间。
去年,Haplogen(现在属于Horizon公司)的人基因敲除细胞系曾被评上十大创新产品,该产品主要通过引入小插入或缺失,改变人类基因的编码区域。Horizon公司今年5月发布On Demand Deletions人Hap1细胞系,可以根据用户要求用CRISPR-Cas9技术删除特定基因组区域,进一步扩展了基因组修饰规模(可达100 Kb),可以研究去除非编码区域的效果。
Promega公司19.1 kDa NanoLuc萤光素酶报告系统采用了NanoBiT技术(NanoLuc Binary Interaction Technology),能够在活细胞中研究蛋白互作。这个荧光标记系统是围绕一对互补亚基建立起来的,发光明亮而且易于检测。爱荷华大学Stefan Strack教授评价称,与类似系统相比,NanoBiT要灵敏得多,而且能用于难以转染的细胞。
9月份,Sigma Aldrich推出的CRISPR表观遗传学激活子,可以通过乙酰化相应组蛋白来启动目标基因,这使得CRISPR应用从基因组编辑拓展到了表观基因组编辑。Johns Hopkins大学Richard Lee认为,该产品很适合研究压力对大脑功能的影响。Sigma Aldrich首席科学家Qingzhou Ji介绍到,除CRISPR激活子外,该产品还可提供靶标Oct4的对照
珀金埃尔默新推出的Phenoptics平台包括染色试剂盒、成像系统和分析软件,可以在福尔马林固定的组织中对免疫细胞进行原位表型分析。珀金埃尔默定量病理成像解决方案全球主管Jim Mansfield表示,Phenoptics成本在14万-35万美元之间,尽管该平台还处于早期使用阶段,但总有一天它会被广泛应用于肿瘤免疫临床研究领域。
Seahorse Bioscience推出的XFp细胞能量表型检测试剂盒,可同时测定活细胞中的两个主要能量生产通路,且操作简单。据了解,XFp可以实时检测线粒体呼吸和糖酵解,计算基线代谢和压力代谢之间的差异,是唯一能测定细胞代谢潜能的产品。值得一提的是,这家公司在今年9月份被安捷伦以2.35亿美元收购。
液体活检是跟踪人体癌症发展的一种极具吸引力的微创方法,作为近年来液体活检的热点,循环肿瘤细胞(CTC)分析可提供蛋白、DNA和RNA活性的全面信息,但在血液样本中收集罕见的CTC并非易事。而Celsee PREP400样品制备系统就可以从血液样本分离CTC。除了捕获活CTC,Celsee PREP400还能将其染色进行多种分析,Celsee ANALYZER则可以对这些细胞进行快速成像分析。
NanoLive公司研发的新型显微镜“3D Cell Explorer”,可以利用类似MRI的技术及全息摄影算法的软件,在不对样本进行预处理的情况下就可以实时观察到活细胞的内部运作,实现单细胞和亚细胞水平的分析,适用范围很广。该显微镜还可利用不同角度的光折射检测细胞,分辨率可达200 nm。